Transfert par le réseau
des données produites par les microscopes
I - Généralités
- Depuis fin 2023, tous les PC pilotant les microscopes de la plateforme ImagoSeine sont reliés au réseau par une fibre optique.
Ils disposent d'une connexion réseau dédiée à 1 Gbits/s, sans goulet d'étranglement vers les serveurs de l'IJM et Internet.
Un débit effectif de transfert aux alentours de 100 Mega-octets/s est donc garanti.
Certains sont connectés à 10 Gbits/s, ce qui permet un débit d'environ 300 Mega-octets/s.
- Ce qui suit explique comment transférer par le réseau les données produites par ces microscopes
- depuis le PC du microscope, sans passer par un disque USB externe
- puis ensuite, depuis le PC/Mac de son bureau
- Ceci dans le but de ne pas utiiser de disques USB externes
- plus lents
- obligent à un double transfert
- sont dangereux pour la sécurité informatique
- Ce qui suit est évidemment valable pour tout autre microscopie ou instrument piloté par un PC
qui se trouve dans les espaces des équipes.
II - Depuis les PC pilotant les microscopes
-
Il est demandé d'utiliser
- le logiciel de transfert FileZilla et le protocole SFTP
- l'identifiant et le mot de passe du compte IJM : celui utilisé pour EasyRequest, eLabFTW, VPN, Seafile, ...
que l'on gère via https://ldap.ijm.fr/
- Deux choix sont proposés
- Données que l'on veut stocker dans un espace temporaire pour les trier, avant de les stocker plus durablement
- Données que l'on veut directement sécuriser sur les serveurs store* (uniquement pour les personnels de l'IJM)
A - Transfert vers un espace temporaire
- Depuis FileZilla, il faut se connecter en utilisant les entrées sitées sous le bandeau ①
- serveur : micro2scratch.ijm.fr -- protocole : SFTP -- port : 22
- login et mot de passe : ceux de son compte IJM
- Dans la partie de droite (②, espace de destination), il convient de
- NE RIEN ECRIRE à cette racine
- descendre dans le dossier DATA dédié à son équipe
- Ensuite on peut lancer le transfert depuis le PC du microscope (③, à gauche de l'écran) vers la zone précédemment sélectionnée
- IMPORTANT : cet espace est de taille illimité, mais sans sauvegarde et il sera vidé automatiquement au bout de 1 moi
- Cet espace temporaire est accessible depuis l'intérieur et l'extérieur de l'Institut exactement de la même façon, sous le nom micro2scratch.ijm.fr
Il peut donc être utilisé par des personnes extérieures à l'Institut
B - Transfert vers son serveur store* (uniquement pour les personnels de l'IJM)
- Il est souligné le caractère très sécurisé (3 copies des données) et pérenne (stockage longue durée sur bandes magnétiques) de ce service de stockage
Aussi il ne faut pas y mettre des données temporaires, en vrac, qui seront triées, renommées, réorganisées par la suite.
En effet, dès la nuit suivante, les nouvelles données seront répliquées une 2ème fois.
Dès le week-end suivant, les nouvelles données seront répliquées une 3ème fois sur bandes pour une durée très longue.
- Depuis FileZilla, il faut se connecter ainsi
- serveur : micro2store.ijm.fr -- protocole : SFTP -- port : 22
- login et mot de passe : ceux de son compte IJM
- Dans la partie de droite (espace destination), il convient de
- NE RIEN ECRIRE à cette racine
- descendre dans le dossier DATA dédié à son équipe
- descendre plus précisément à l'endroit souhaité
- cf plus haut : il est important de placer directement les données au bon endroit
- Ensuite on peut lancer le transfert depuis le PC du microscope (à gauche de l'écran) vers la zone précédemment sélectionnée
III - Depuis son PC/Mac à son bureau
- Si on a mis ses données dans l'espace temporaire, on y accède donc exactement de la même façon que depuis le PC du microscope.
De nombreux logiciels (FileZilla, WinSCP, Cyberduck, rsync, etc) peuvent être utilisés.
Des versions récentes de FileZilla sont DISPONIBLES ICI.
- Si on a mis ses données sur les serveurs store* de l'IJM, on y accède comme d'habitude.
Aucun nouveau transfert n'est à effectuer